Il gioco Adventure Island 3 per NES è un sequel della serie Adventure Island, in particolare della sua seconda parte Adventure Island 2, che racconta le avventure dell'isolano Master Higgins. Secondo la trama del gioco, Higgins si fa rapire la sua ragazza dagli alieni e si lancia in pericolose avventure per salvarla.
I livelli di Adventure Island 3 rappresentano isole diverse, ognuna con i propri abitanti, la propria natura, il proprio terreno e i propri pericoli. Per raggiungere la sua ragazza, il protagonista deve superare tutte le prove su ogni isola e sconfiggere i boss. Il percorso tra le isole può essere accorciato o modificato, caratteristica che rende il gioco non semplice e più interessante.
Il protagonista può raccogliere vari frutti lungo il percorso per ricaricare il tempo e le vite, nonché armi da lancio e, soprattutto, dinosauri. I dinosauri nel gioco occupano un ruolo a parte: quello di trasporto e di armamento allo stesso tempo. Il dinosauro può essere trovato nell'uovo, ogni isola ha il suo tipo di dinosauro, che ha le sue caratteristiche. C'è un dinosauro volante (pteradactel), ce n'è uno galleggiante e ci sono dinosauri terrestri.
In Adventure Island 3 c'è una nuova arma, il boomerang, e un nuovo dinosauro con tre corna. A differenza delle parti precedenti del gioco, Adventure Island 3 permette di combattere i boss in cima al dinosauro.