Das NES-Spiel Ninja Gaiden 3: The Ancient Ship of Doom, oder Ninja Gaiden 3, ist ein Action-Plattformer und ist die Fortsetzung der Serie, genauer gesagt des zweiten Teils - Ninja Gaiden 2: The Dark Sword of Chaos.
In der Handlung des dritten Teils versucht der Protagonist Ryu Hayabusa, der beschuldigt wird, Irene Liu ermordet zu haben, die Ursache für ihren Tod zu finden. Dabei findet er heraus, dass ein CIA-Agent den Plan hat, mit Hilfe eines interdimensionalen Spalts Mutanten zu erschaffen. Die Handlung ist ziemlich verworren und enthält Verweise auf die Teile eins und zwei des Spiels.
Das Gameplay von Ninja Gaiden 3: The Ancient Ship of Doom ist identisch mit dem der vorherigen Teile und setzt deren bewährten Stil fort. Die Hauptfigur kann springen, laufen, Wände hochklettern und Nahkampf- und Wurfwaffen benutzen. In den Levels gibt es verschiedene Boni, wie Gesundheitsregeneration und Waffenaufwertungen. Ein neuer Gegenstand in Ninja Gaiden 3 ist das Drachenschwert, das eine größere Reichweite hat. Am Ende eines jeden Levels gibt es einen Bosskampf.
Insgesamt ist Ninja Gaiden 3: The Ancient Ship of Doom eine würdige Fortsetzung von Teil 2 und der letzte Titel der Serie und verdient daher die Aufmerksamkeit von Fans des Genres und der Ninja Gaiden-Serie.